Филиал Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова в городе Баку создан Постановлением Президента Азербайджанской Республики от 15 января 2008 года №2621 «Об организации деятельности филиала Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова в г. Баку» и Приказом ректора МГУ имени М.В. Ломоносова от 25 сентября 2007 г. Официальное открытие филиала состоялось 27 февраля 2009 года. 26 сентября 2012 года состоялась церемония открытия нового учебного комплекса филиала МГУ имени М.В.Ломоносова в городе Баку.
